Das Schiffahrtmedizinische Institut der Marine in Kronshagen wurde am 2. Januar 1961 unter der damaligen Bezeichnung Uboots- und Taucherphysiologisches Institut der Marine mit Sitz im Sanitätsbereich der Technischen Marineschule I gegründet und ist das zentrale Institut der Bundeswehr für Schifffahrt- und Tauchmedizin. Ihren heutigen Namen trägt die Dienststelle seit dem 1. Mai 1965. Die Dienststelle ist seit August 1961 auf dem Gelände des ehemaligen Marinelazaretts untergebracht. Mit der Transformation der Bundeswehr und der damit einhergehenden Umstrukturierung des Sanitätsdienstes der Marine ging die truppendienstliche Führung erneut auf den Amtschef des Marineamtes über.
Das Leistungsspektrum umfasst heute die gesamte maritime Medizin. Dazu zählen die Arbeits- und Umweltmedizin an Bord, die Schifffahrtsmedizin, die maritime medizinische Ergonomie, die Marinepsychologie sowie die Tauch- und Überdruckmedizin.
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